پس از تساوی استقلال در دیدار مقابل ملوان در هفته دوم موج اول حمله به سرمربی تیم استقلال استارت خورد و در همان برهه شرایط برای جواد نکونام سخت شد. بلافاصله پس از آن بود که استقلالیها در دیدار مقابل استقلال خوزستان شکست خوردند و این موج به راه افتاده با شدت و ارتفاع بیشتری به سوی کادر فنی استقلال و به ویژه جواد نکونام حرکت کرد.
طرفداران استقلال که مقصر اصلی در کسب نتایج تساوی و شکست مقابل ملوان و استقلال خوزستان را جواد نکونام میدانستند در این مدت بارها و بارها در صفحات مجازی و از طریق ارتباط با پیشکسوتان استقلال عنوان کردند که میخواهند این مربی دیگر در تیمشان نباشد. تاکید بر استفاده از مربی خارجی همچون تیمهای سپاهان، پرسپولیس و تراکتور این موضوع را به شکلی پیش برد که وضعیت برای کادر فنی تیم استقلال بیش از پیش سختتر شد.
این شرایط به قدری برای جواد نکونام سخت بود که مجبور شد در روزهایی که باشگاه استقلال کمترین توجه و حمایت را به او داشت و به جای اینکه در رسانه رسمی باشگاه حرفهایش را بزند از طریق دیگری صحبت کرد و گفت که میخواهد هرچه دارد و ندارد را برای استقلال بگذارد و این تیم را موفق کند اما این اقدامات هم مانع از حمله هواداران به او نشد.
در حال حاضر به نظر میرسد این تغییرات تا اطلاع ثانوی غیرممکن بوده و استقلالیها با همین شرایط و کادر فنی در حال آماده شدن برای دیدار مقابل الغرافه قطر در چهارچوب هفته اول رقابتهای لیگ نخبگان آسیا هستند.