استقلال در حالی دور رفت لیگ برتر بیست و یکم را به پایان رساند که تنها پنج بار دروازه اش را باز شده دید.
سید حسین حسینی در دور رفت لیگ بیست و یکم در ۱۲ دیدار فقط ۳ بازی گل خورد و ۹ کلین شیت داشت. او در هفته های پایانی مقابل تیم‌هایی مثل نفت مسجد سلیمان و فولاد در چند صحنه توپ های تک به تک و شوت های خطرناک را مهار کرد.
دروازه بان ۲۹ ساله استقلالی ها اولین گل این فصل را در زادگاهش و مقابل فجر شهید سپاسی شیراز خورد. جایی که بسیاری از کارشناسان معتقد بودند به دلیل لغزندگی زمین باران خورده سرخورد و نتوانسته توپ ارسالی از کرنر را به درستی دفع کند.
دومین گل خورده این فصل حسینی مقابل آلومینیوم اراک بود. جایی که عارف آقاسی نتوانست توپ را به درستی دفع کند و بازیکن تازه وارد میزبان با یک ضربه دور از دسترس حسینی توپ را به تیر دروازه کوبید و گل شد.
دو گل دیگری که حسینی در نیم فصل اول خورد مقابل مس رفسنجان بود تا مجموع گل های خورده این دروازه بان در ۱۲ بازی چهار گل باشد.
حسینی پیش از این رکورددار کلین شیت در لیگ برتر هم بوده و در دوران سرمربیگری کارلوس کی روش به اردوی تیم ملی دعوت می شد. او در سال ۲۰۱۸ در سه دیدار مقابل تیم‌های سیرالئون و ازبکستان(هر کدام یک نیمه) و ترینیداد و توباگو(۹۰دقیقه) تحت هدایت کارلوس کی روش برای تیم ملی به میدان رفت. او همچنین در شش بازی نیمکت نشین تیم ملی بود اما در آستانه حضور ایران در جام جهانی روسیه از لیست نهایی سرمربی پرتغالی خط خورد.
حسینی پس از آن و در دوران سرمربیگری مارک ویلموتس نیز به اردوی تیم ملی دعوت و مقابل هنگ کنگ در خانه حریف ۹۰ دقیقه نیمکت‌نشین علیرضا بیرانوند بود. پس از مارک ویلموتس، سید حسین حسینی دیگر هرگز به اردوی تیم ملی دعوت نشد ولی همچنان امیدوار است که دوباره بتواند پیراهن تیم ملی را بر تن کند.
حسینی که فصل گذشته (لیگ بیستم) نیمکت نشین محمد رشید مظاهری بود، به قدری با انگیزه تمرین کرد که هر زمان به میدان آمد توانست بازی قابل قبولی از خود به نمایش بگذارد. او در فصل بیست و یکم و با حضور همین دروازه بان توانست به دروازه‌بان اصلی تیم استقلال تبدیل شود.
به تازگی و در روزهایی که موضوع اعلام لیست تیم‌ملی سوژه اول فوتبالیست ها به ویژه بازیکنان استقلال بود حسینی این موضوع را دوباره مطرح کرده که "اینقدر خوب کار می کنم تا دوباره به تیم ملی برگردم".
